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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café. |
Data corrente: |
05/02/2015 |
Data da última atualização: |
06/02/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CARDOSO, D. C.; MARTINATI, J. C.; GIACHETTO, P. F.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. |
Afiliação: |
DANIELLE C. CARDOSO, IAC; JULIANA C MARTINATI, IAC; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; RAMON O. VIDAL; MARCELO F. CARAZZOLLE; LILIAN PADILHA, SAPC; OLIVEIRO GUERREIRO-FILHO, IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, SAPC. |
Título: |
Large-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London, v. 15, p. 1-20, 2014. |
DOI: |
10.1186/1471-2164-15-66 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A successful development of herbivorous insects into plant tissues depends on coordination of metabolic processes. Plants have evolved complex mechanisms to recognize such attacks, and to trigger a defense response. To understand the transcriptional basis of this response, we compare gene expression profiles of two coffee genotypes, susceptible and resistant to leaf miner (Leucoptera coffella). A total of 22000 EST sequences from the Coffee Genome Database were selected for a microarray analysis. Fluorescence probes were synthesized using mRNA from the infested and non-infested coffee plants. Array hybridization, scanning and data normalization were performed using Nimble Scan® e ArrayStar® platforms. Genes with foldchange values +/-2 were considered differentially expressed. A validation of 18 differentially expressed genes was performed in infected plants using qRT-PCR approach. |
Palavras-Chave: |
Microarranjo; Plant defense. |
Thesagro: |
Café; Coffea Arábica. |
Thesaurus Nal: |
Genes; Leafminers; Microarray technology. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117310/1/Large-scale-analysis.pdf
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Marc: |
LEADER 01841naa a2200301 a 4500 001 2007801 005 2015-02-06 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/1471-2164-15-66$2DOI 100 1 $aCARDOSO, D. C. 245 $aLarge-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aA successful development of herbivorous insects into plant tissues depends on coordination of metabolic processes. Plants have evolved complex mechanisms to recognize such attacks, and to trigger a defense response. To understand the transcriptional basis of this response, we compare gene expression profiles of two coffee genotypes, susceptible and resistant to leaf miner (Leucoptera coffella). A total of 22000 EST sequences from the Coffee Genome Database were selected for a microarray analysis. Fluorescence probes were synthesized using mRNA from the infested and non-infested coffee plants. Array hybridization, scanning and data normalization were performed using Nimble Scan® e ArrayStar® platforms. Genes with foldchange values +/-2 were considered differentially expressed. A validation of 18 differentially expressed genes was performed in infected plants using qRT-PCR approach. 650 $aGenes 650 $aLeafminers 650 $aMicroarray technology 650 $aCafé 650 $aCoffea Arábica 653 $aMicroarranjo 653 $aPlant defense 700 1 $aMARTINATI, J. C. 700 1 $aGIACHETTO, P. F. 700 1 $aVIDAL, R. O. 700 1 $aCARAZZOLLE, M. F. 700 1 $aPADILHA, L. 700 1 $aGUERREIRO-FILHO, O. 700 1 $aMALUF, M. P. 773 $tBMC Genomics, London$gv. 15, p. 1-20, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
12/12/2013 |
Data da última atualização: |
20/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SOUZA, L. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; MOURA, M. S. B. de; BARBOSA, M. L.; MORAIS, J. E. F. de. |
Afiliação: |
LUCIANA SANDRA BASTOS DE SOUZA, Doutoranda da UFV; THIERES GEORGE FREIRE DA SILVA, UFRPE; MAGNA SOELMA BESERRA DE MOURA, CPATSA; MARCELA LÚCIA BARBOSA; JOSÉ EDSON FLORENTINO DE MORAIS. |
Título: |
Controle da evapotranspiração da cana-de-açúcar irrigada no Semiárido brasileiro. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS NATURAIS DO SEMIÁRIDO, 1., 2013, Iguatu. Pesquisa e transferência de tecnologia contextualizada ao Semiárido: anais. Iguatu: Universidade Federal do Ceará; Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Ceará, 2013. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho é analisar variação sazonal do controle da cana-de-açúcar ao processo de evapotranspiração sob as condições climáticas do Semiárido brasileiro. O experimento foi realizado no município de Juazeiro, Bahia. A evapotranspiração da cultura foi quantificada por meio do método do balanço de energia com base na razão de Bowen. Para analisar o controle da cana-de-açúcar ao processo de evapotranspiração foi utilizado o fator de desacoplamento. Para o ciclo, os valores de Ω foram, em média, iguais a 0,68, demonstrando um desacoplamento moderado. Observou-se pouca alteração no valor médio final, sendo igual a 0,69, quando se retirou o efeito do tombamento da cultura. Estes resultados indicam que, o sistema clima induziu ao maior controle da cana-de-açúcar no processo de troca de vapor d?água com a atmosfera. |
Palavras-Chave: |
Cana-de-açúcar. |
Thesagro: |
Evapotranspiração; Irrigação. |
Thesaurus NAL: |
Irrigation; Sugarcane. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/93917/1/Magna-1.pdf
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Marc: |
LEADER 01738nam a2200217 a 4500 001 1973730 005 2024-02-20 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSOUZA, L. S. B. de 245 $aControle da evapotranspiração da cana-de-açúcar irrigada no Semiárido brasileiro.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS NATURAIS DO SEMIÁRIDO, 1., 2013, Iguatu. Pesquisa e transferência de tecnologia contextualizada ao Semiárido: anais. Iguatu: Universidade Federal do Ceará; Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Ceará$c2013 520 $aO objetivo deste trabalho é analisar variação sazonal do controle da cana-de-açúcar ao processo de evapotranspiração sob as condições climáticas do Semiárido brasileiro. O experimento foi realizado no município de Juazeiro, Bahia. A evapotranspiração da cultura foi quantificada por meio do método do balanço de energia com base na razão de Bowen. Para analisar o controle da cana-de-açúcar ao processo de evapotranspiração foi utilizado o fator de desacoplamento. Para o ciclo, os valores de Ω foram, em média, iguais a 0,68, demonstrando um desacoplamento moderado. Observou-se pouca alteração no valor médio final, sendo igual a 0,69, quando se retirou o efeito do tombamento da cultura. Estes resultados indicam que, o sistema clima induziu ao maior controle da cana-de-açúcar no processo de troca de vapor d?água com a atmosfera. 650 $aIrrigation 650 $aSugarcane 650 $aEvapotranspiração 650 $aIrrigação 653 $aCana-de-açúcar 700 1 $aSILVA, T. G. F. da 700 1 $aMOURA, M. S. B. de 700 1 $aBARBOSA, M. L. 700 1 $aMORAIS, J. E. F. de
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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